Desde a sua criação, a ATEC procura estabelecer parcerias com Universidades e Institutos Politécnicos, a nível nacional, com vista à atribuição de créditos em diversas unidades curriculares de cursos de engenharia aos seus formandos dos cursos de especialização tecnológica (CET) que terminem a formação na ATEC com aproveitamento.
Recentemente, foi assinado mais um Protocolo de Cooperação desta vez com a Faculdade de Ciências e Tecnologia da Universidade Nova de Lisboa (FCT-UNL), sita no Monte da Caparica, Almada. Desta forma os formandos de Especialização Tecnológica da ATEC passam a dispor de mais uma alternativa para o prosseguimento dos seus estudos a nível superior, numa faculdade de reconhecida qualidade e mérito.
Neste momento temos em vigor diversos protocolos de cooperação:
